波罗的海国际海事协会（BIMCO）的评估显示，由於受到地震和海啸冲击，日本工厂将在一段时期内停止生产，导致出口量大跌，目前各集装箱航线纷纷暂停挂靠日本港口。

BIMCO表示，短期内航运需求回升过程缓慢，中期至远期会高些，因为重建会带动对原材料的需求。

但有业界人士对日本的恢复表示有信心。一位阿拉伯船公司的高层在接受《海湾时报》（Gulf Times）的采访时表示，获悉日本政府已经迅速推出多项应对措施。

据美国《商业日报》报道，海啸袭击日本当日，原计划要前往横滨港的船舶达40艘。由於日本是电煤、铁矿石、焦煤和粮食进口大国，乾散货航运也会受影响。由於多所核电厂失灵或停运，日本对电煤的需求将激增。

台湾的万海航运目前仍然提供至日本的集装箱航运服务，并呼吁同行响应对日本的救助。万海挂靠的港口包括东京、千叶、博多、川崎、神户、水岛、门司、名古屋、大阪、清水、德山、四日及横滨。

商船叁井已经成立了由公司主席武藤幸一领导的特别小组，支援日本东北部的灾民，并决定为救援行动捐助5,000万日元。公司内部员工也已组织了捐款活动。另外，应政府要求，商船叁井渡轮公司将承担自卫队救援人员的运输。